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霉菌儲糧水分的高低是霉菌生長的重要決定因素，也是糧食儲藏過程中發生霉變的主要原因。糧食入庫時需嚴格控制含水量，曬干入庫，種子的含水量不宜超過15%；在倉庫內放置無水氯化鈣、草木灰等降低空氣濕度，將相對濕度降低到60%以下；糧倉等設備建好防潮地坪和防潮墻以隔離濕氣。此外，混在糧食中的各種雜質、破損粒和不成熟粒等往往攜帶大量的微生物，一般1g糧食含微生物4000多個，而1g雜質含微生物高達50000多個。新糧入倉前利用風車和清理篩等清除混在糧食中的各種雜質，保持糧食清潔衛生和糧粒完整。糧食入倉前利用乙醇、次氯酸鈣、次、二氧化氯和氧化氫等消毒劑對倉儲設施進行消毒處理，殺滅霉菌。
為了解決防治抗性害蟲的問題，研究者對熏蒸劑做了大量研究：1、利用辣根素在２８℃時熏蒸處理玉米，兩天后發現，辣根素對赤擬谷盜，谷蠹和玉米象有明顯抑制效果。2、為了探究玉米氨氣熏蒸儲藏對毒B1（AFB1）的降解率，設計了熏蒸溫度、氨氣濃度、熏蒸時間及玉米水分對AFB1降解率的影響實驗，再由正交試驗及響應面分析得到佳組合：熏蒸溫度37℃、玉米水分20％、氨氣體積分數7.05％、熏蒸時間96h，玉米實測降解率值為92％。
將不同水分（13.2％和14.0％）的玉米在不同溫度（20℃、25℃和30℃）條件下，采用持續充氮氣調、交替充氮氣調和常規方式儲藏了18個月，旨在研究不同氮氣氣調濃度（90％、95％和98％）和方式對玉米脂肪酸值的影響，結果顯示：在20℃～30℃時，氮氣濃度在90％以上或交替充氮氣調儲藏方式均可減緩玉米脂肪酸值的增加，連續充氮氣調儲藏方式對減緩玉米脂肪酸值升高的效果較好，而且充氮氣調儲藏啟封后，玉米的脂肪酸值不會受到影響。
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